遠期 2030年前，建成4條城際軌道

另外，廈漳泉城際軌道規劃還分遠期（2030年）和遠景（2030年以后）兩個時間段來擬定整個線網，其中遠期線網主要是配合大城市區城際主體規劃以支持2030年總體規劃發展戰略的實現，共規劃四條線。

1號線 起于龍廈鐵路的靖城火車站，經過漳州金峰組團，經過漳州中心城區，經過漳州江東，串聯角美和臺商投資區，經過海滄到廈門島，經過規劃的翔安機場，經過泉州的晉江、中心城區、泉州臺商投資區、惠安、泉港區，最終在北部的仙游火車站接上福廈鐵路。

2號線 作為南北向的輔助交通走廊，南部起于漳州龍海，經過廈門海滄，在廈門島外串聯廈門四大新城，向北經過翔安，經晉江和石獅之間規劃的預留交通走廊，向北接到城際軌道1號線。3號線連接漳州中心城區，經過九龍江南岸，連接漳州開發區、南太武新區等具有發展潛力的城市組團，未來與城際軌道1號線，將形成一個Y字形的城鎮發展走廊，在九龍江沿岸，真正實現沿江面海的大漳州發展戰略。4號線起于石獅永寧，經晉江城區，向西與南安、安溪串聯，構建一個城鎮交通發展走廊。

展望 向東延伸到臺灣

在2030年基礎上，規劃又構建了一個遠景線網，增加了5條線，在北部預留向北連接福州大都市區的條件，向南預留延伸至東山、詔安的條件，向西預留連接龍巖、三明的接口，向東預留未來延伸至臺灣的條件。

5號線 位于漳州境內，起于漳浦，經南靖、平和，串聯山區三大縣城。

6號線 銜接金門和規劃的翔安機場，未來還可考慮進一步延伸至臺灣。

7號線 連接泉州環灣核心區，經過泉州臺商投資區，經泉州北部新火車站，未來終點將考慮延伸到永春。

8號線 起于1號線的仙游站，經過仙游縣城，經南安，未來形成一個環狀的鐵路網。

9號線 廈門火車站向南跨過廈門灣后，經過港尾與3號線銜接，未來可以在廈門北站開出從廈門北經過廈門島，到漳州的南太武新區，連接東山島。